Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APAF1O14727 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms