Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01387J3KSC0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms