Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PATL2C9JE40 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms