Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A8MVJ9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
A8MVJ9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
A8MVJ9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
A8MVJ9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A8MVJ9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms