Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SOBPA7XYQ1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SOBPA7XYQ1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms