Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPIPB13A6NJU9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms