Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NIN4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NIN4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NIN4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NIN4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NIN4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NIN4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NIN4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms