Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC182A6NF36 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms