Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F8A0AVK6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms