Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCOA3Q9Y6Q9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms