Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms