Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNQ9UQP3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNQ9UQP3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms