Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHOC2Q9UQ13 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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