Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK1Q9UPV9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms