Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP22Q9UPT9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP22Q9UPT9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms