Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLEC4AQ9UMR7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms