Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDRG4Q9ULP0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms