Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms