Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTNNA3Q9UI47 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms