Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms