Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DKK2Q9UBU2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms