Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms