Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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