Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TOR4AQ9NXH8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms