Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO28Q9NVF7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO28Q9NVF7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms