Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINM1Q9NU53 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms