Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms