Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FSCN3Q9NQT6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms