Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms