Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPAG4Q9NPE6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms