Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRA1Q9HD15 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms