Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMURF2Q9HAU4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms