Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms