Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNCQ9H7C4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNCQ9H7C4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms