Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHARPINQ9H0F6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms