Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CTDSP1Q9GZU7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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