Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms