Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIPCQ9C0C6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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