Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIM8Q9BZR9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms