Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCO2Q9BYV7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms