Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC46A2Q9BY10 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms