Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BBS2Q9BXC9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms