Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms