Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms