Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LIMD2Q9BT23 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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