Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF25Q9BQ70 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCF25Q9BQ70 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms