Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD5Q99666 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD5Q99666 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms