Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMNAT3Q96T66 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMNAT3Q96T66 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms