Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CITED4Q96RK1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CITED4Q96RK1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms