Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARXQ96QS3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARXQ96QS3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms